Ein wichtiges Thema in der Verwaltung von Baugenossenschaften ist die Beziehung zwischen Bauherrschaft und Planern. Für komplexe Projekte empfiehlt sich, dass die Bauherrschaft einen «Projektleiter Bauherr» als gewichtiges Gegenüber zum Gesamtleiter auf der Planerseite ernennt.
Eine Möglichkeit zur Optimierung der Führung und Verwaltung von gemeinnützigen Bauträgern kann eine Fusion sein. Diesen Weg sind zwei Willisauer Baugenossenschaften gegangen.